尽管预制菜仍在快速发展，不过此前南都湾财社记者在走访预制菜企业的过程中了解到，预制菜仍存在口味难还原、C端接受度不高、缺乏强制性标准等难题。
对于预制菜难以还原现炒菜的口味，C端接受度不高，佛山市顺德区质量技术监督标准与编码所任标准化工程师何月在会上指出，如何在保质期之内最大程度地还原菜品的口味，这给企业出了一个比较大的难题。特别是广东的消费者比较追求菜品的新鲜。因此，在保证口味还原方面，企业可以在原材料的选取、工艺的选取以及冷链运输上下功夫，除此之外，食品生产企业还要给消费者介绍最佳的烹饪方式，常温解冻抑或流水解冻，大火加热还是小火加热，口味肯定有区别的。
徐春建则认为，预制菜绝大部分的潜力市场在C端，要解决C端接受度不高的问题，要先解决最后一公里的问题，即最后一公里的冷链存储及配送问题。目前许多终端的存储设备并不是为预制菜去定制的设备，其温度存储、湿度控制以及对食品的杀菌标准等远远达不到预制菜的存储条件的。这虽然不是预制菜产品的问题，但是消费者会把这种消费感受归咎到预制菜企业，所以未来预制菜企业要做好全链条的管控。
而针对预制菜缺乏强制性、统一的标准问题，品珍科技创始人兼CEO陈翠颖指出，对于预制菜行业而言，标准的建立对于预制菜是非常紧迫需要的，不过品珍作为面向C端的品牌，希望预制菜标准可以往更高的标准去建立。“最近我们接触了不少国外采购商，但是在深入沟通的时候发现，各国在进口的标准里面是不一样的，不少国家的进口的标准比国内的标准高很多，所以就变成了国外有需求但是我们很多时候不符合要求，符合要求的国家价格要价又非常高，所以标准希望可以往更高的制定。
